该书将文献分为医经、本草、食治、藏象、诊法、明堂经脉、方论、史传、运气九类，基本反映了中医学文献的具体内容以及当时中医学的学科体系，这种分类方式对后世中医文献的整理和研究具有重要的借鉴意义。
全书共 80 卷，著录中医文献二千八百八十余种，涉及作者一千二百八十余人，所收录文献上起秦汉下至清道光年间，基本涵盖了这一漫长历史时期的主要医学著作，为中医文献学、中医学史的研究提供了极其丰富的原始资料，是研究中国古代医学文献不可或缺的重要工具书。
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